2010年12月11日，农业部种植业管理司在北京组织有关专家，对中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花品质监督检验测试中心完成的“棉种质量南繁纯度检测技术体系”成果进行了鉴定。专家委员会听取了汇报，审查了有关技术资料，进行了质询答疑。经过认真讨论，形成如下鉴定意见：

　　一、在国内首次建立了全国棉种纯度规模化南繁鉴定技术平台，解决了全国当年生产的棉花种子大规模纯度鉴定的难题。鉴定结果准确可靠，至今从未出现质量事故和纠纷争议，保证了国家质量技术监督局和农业部历年下达的棉种质量检测任务的完成，为全国棉种质量控制提供了依据。

　　二、系统研究并确定了能够有效鉴定棉种纯度的21个关键性状和25个辅助性状，制定了《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南——棉花》国家标准，规范了棉种田间纯度鉴定技术。

　　三、建立了一种新的棉花种子快速发芽方法，种子发芽时间比传统方法缩短7—9天。形成了农业行业标准，并获得国家发明专利，为棉花南繁一播全苗、种子生产加工质量控制和棉种贸易快速质量检测提供了保证。

　　四、基于SSR分子标记技术，建立了一套快速、准确、可靠的棉种DNA指纹检测技术体系，并采用卡那霉素法辅助快速检测转基因抗虫棉，对分子育种、资源鉴定和品种管理具有重要参考价值。

　　该项成果研究方法科学、设计合理，资料齐全、翔实可靠。建立了系统的棉花南繁鉴定技术体系，具有明显创新性。自1993年以来，共抽查棉种生产与经销企业680家（次），样品715份，总体合格率由开始的50%左右上升到近年来的95%以上，对促进我国棉种质量水平提高和规范棉种市场起到了重要作用，取得了显著的经济、社会效益。

　　成果整体水平居国际先进、国内领先。