近日，中国农业科学院棉花研究所野生棉研究团队联合三亚华大生命科学研究院、三亚智数生物科技有限公司发布棉花50K液相SNP芯片（ID GenXP-LiqTag® CustomPanelCotton50kv1.0），为棉花分子育种提供稳定、高性价比的高通量分型方案。

棉花是我国重要经济作物，种质精准鉴定、骨干亲本解析、基因组选择育种是种业振兴的关键。当前分子育种加快产业化，但传统高密度分型芯片长期存在成本偏高、适配样本类型有限、功能位点覆盖不足等问题，制约育种单位将基因组数据转化为育种决策。

该芯片依托2910份棉花种质重测序数据，利用液相探针捕获技术开发而成，通过研发团队自主开发的MarkerHunter软件完成标记筛选，经严格过滤，整合了1642个覆盖产量、纤维品质、株型、抗病、棉籽含油量、早熟等核心性状的育种前景位点，最终包含48664个高质量SNP位点。实测结果显示，该芯片平均分型成功率98.87%，目标位点平均测序深度135X，技术重复分型一致率99.9991%，前景位点重复一致率达100%，分型性能稳定可靠，可实现一芯多用，一站式支撑种质资源评价、品种分子身份证构建、分子标记辅助选择、全基因组选择、GWAS分析与连锁图谱构建、亲本组配决策六大育种场景。

目前，该芯片已开放样本检测业务，面向科研单位、育种企业承接合作，着力为我国棉花种业创新与振兴提供科技支撑。