本发明公开了GhPRXR1蛋白及其编码基因在调控棉籽含油量中的应用。本发明从陆地棉材料Msco‑12中克隆出棉花GhPRXR1基因,成功构建酵母过表达载体并转化酿酒酵母。3个阳性转基因酵母与转空载体酵母对照相比,油份含量分别提高了20.01%、34.79%和37.25%。本发明还成功构建了病毒诱导GhPRXR1基因沉默载体,并转化陆地棉Msco‑12。6个GhPRXR1基因沉默棉花阳性单株成熟棉籽平均含油量与3个对照单株成熟棉籽平均含油量相比降低了18.11%。说明GhPRXR1基因可调控棉籽含油量,在改良棉籽油产量及棉花育种中具有重要价值。