本发明公开了一种植物种子脂肪酸相关蛋白GhbZIP67及其编码基因和应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a1)或(a2):(a1)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(a2)将序列表中序列1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物种子油分相关的由序列1衍生的蛋白质。本发明提供了GhbZIP67蛋白及其编码基因,可以调控植物种子脂肪酸含量。本发明对于培育棉花新品种具有重要的意义,适合于推广应用。