本发明属于农业生物技术领域，具体涉及棉花抗黄萎病相关基因GhABC及其编码蛋白和应用。本发明的棉花抗黄萎病相关基因GhABC的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示，其编码蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示。本发明对基因沉默植株接种棉花黄萎病病原菌Vd080孢子悬浮液后，沉默植物表现更感病，通过机理研究发现，沉默植株中木质部和胼胝质的合成下降，ROS减少，部分防御基因下调表达。证明了GhABC与棉花抗黄萎病呈正相关，GhABC可作为棉花抗病育种的候选基因。
