本发明属于棉花分子生物学、基因工程技术领域,尤其涉及一种控制亚洲棉光籽性状基因及其编码的蛋白质以及应用,所述基因命名为GaFZ,该基因仅有一个外显子无内含子,长度为264 bp,所述基因和编码蛋白的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示,通过解析该基因的分子生物学功能,探究其对表皮毛和棉纤维发育的分子机制,进而利用该基因提高棉纤维产量,培育环境友好型棉花品种。