本发明公开了一种筛选抗冷棉花品种的方法及其应用,包括如下步骤:(1)将不同品种的棉花种子进行播种,播种2天后幼苗出土,第4天去除长势不均一的幼苗,保持其他幼苗继续生长;(2)幼苗长至第7天子叶平展,将幼苗进行冷适应后,然后进行冷处理,再进行热适应和恢复处理,统计成活率和统计子叶冷害级别,然后计算形态指标,测定冷处理72小时的离体叶片的相对电导率,根据形态指标或相对电导率评定抗冷性。