本发明提供与陆地棉叶片绒毛相关的SNP分子标记及其应用,属于分子生物学领域。本发明与陆地棉植株绒毛相关的SNP标记共31个,这些标记具有SEQ ID No.1~SEQ ID No.31所示的DNA序列,这些SNP分子标记单独或任两个或多个组合应用均可用于陆地棉植株绒毛的早期预测,还可用于棉花遗传背景分析和筛选,以及植株绒毛位点分子标记辅助选择育种,具有广阔的应用前景。