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        本发明公开了一种与棉花高强纤维主效基因连锁的分子标记，用以下方法获得的：以新陆早24为父本，鲁棉研28号和冀棉516为母本，分别构建两个F2和F2:3分离群体。用SSR引物进行亲本间(鲁棉研28号和新陆早24)多态性筛选，利用F2构建遗传连锁图谱，进行两世代QTL定位。根据定位结果，挑选与高强纤维主效基因连锁的SSR标记对亲本新陆早24和冀棉516的DNA多态性进行分析，并构建遗传连锁图谱和定位QTL。一个纤维强度主效QTL(qFS-6-2)在两个群体两个世代都稳定检测到，位于染色体c7的DPL0757-DPL0920标记区间内，增效基因来自亲本新陆早24，qFS-6-2的连锁标记为DPL0757130，DPL0852170，DPL0920130。利用本发明标记进行分子标记辅助选择，可提高棉花纤维强度的选择效率。