本发明涉及一种快速鉴定萌发期棉花种子耐盐性的方法。本发明所述方法是通过电生理技术,以胚根中氯离子外排速率的高低作为棉花种子耐盐性强弱的评价指标,提供了一种简便、实用、科学、新颖的鉴定方法,采用本发明所述方法能够高效、快捷的鉴定与筛选出棉花萌发期耐盐性种子品种。