论文简介:在本研究中,我们结合了全基因组关联分析(GWAS)和连锁图谱来鉴定和验证纤维长度(FL)相关的高质量的QTL。对于GWAS,我们基于355份材料的8个不同的环境中检测的纤维长度数据开发了93,250个高质量的单核苷酸多态性(SNP)标记。对于连锁图谱,我们利用两个极端材料构建了一个F2群体。高密度连锁图谱的区间跨度是3,848.29 cM,标记平均间隔1.41 cM。关联分析和连锁图谱分别鉴定出14个和13个QTLs。更重要的是,鉴定出的一个主要的在D03染色体上的QTL在两个群体中均解释超过10%的表型变异。此外,在这个QTL区域我们发现一个与纤维长度相关联的蔗糖合成相关基因(Gh_D03G1338)。RNA-seq数据显示Gh_D03G1338在纤维发育阶段高表达,并且qRT-PCR分析表明在长纤维和短纤维品种中表达水平有显著性差异。这些结果表明,Gh_D03G1338可能通过调控蔗糖的合成来决定棉纤维的伸长。
原文链接:https://doi.org/10.3389/fpls.2019.00053