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Comprehensive analysis of NAC transcription factors in diploid Gossypium: sequence conservation and expression analysis uncover their roles during fiber development

  • 期刊名称Science China Life Sciences
  • 发表年份2016
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  • 添加时间2021年09月18日

论文简介:转录因子 (TF) 是一类通过与基因启动子中的特定顺式作用元件结合来调节基因表达的蛋白质。靶基因随后激活或抑制它们的转录。在本研究中,我们通过系统地分析 NAC 转录因子 (NAC-TFs) 家族的染色体位置、结构,使其功能多样化Gossypium raimondii (Gr) 和 G. arboreum (Ga) 中的性质、系统发育和表达模式,分别在 Gr 和 Ga 基因组中鉴定了145 和 141 NAC 基因,并注释分为 18 个亚科,这些亚科显示出明显的差异,揭示了纤维发育过程中基因结构和表达模式的趋同性。此外,当功能参数调整后,在串联簇内观察到明显的分化,这表明发生了亚功能化在重复基因之间。同源基因对的表达模式也发生了变化,这表明在二倍体棉花进化过程中基因的多样化是导致基因功能不同的原因,这些发现提供了对基因功能潜在机制的研究提供了理论基础。

原文链接:https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-016-5001-1