论文简介：为研究衣分的遗传结构，种植了一个由355个陆地棉材料组成的群体并且在四个不同的环境中测了衣分。利用特异性位点扩增片段测序（SLAF-seq）进行基因分型。通过全基因组关联分析(GWAS)检测到12个与衣分相关的单核苷酸多态性(SNPs)，其中5个SNP位点分布在At3 (A02)和At4 (A08)染色体上，包含两个主效QTLs，这些是在最佳线性无偏预测(BLUPs)和同时在三个以上的环境中检测到的。此外，鉴定到这些关联位点的两个连锁不平衡区块中的两个主效QTLs的有利单倍型和47个推测的候选基因。利用10个陆地棉花组织的RNA-seq数据估计了这些推测的候选基因的表达水平。我们发现Gh_A02G1268在纤维发育的早期阶段表达量非常高，而该基因在种子中表达量很低。这些结果暗示Gh_A02G1268可能通过调控纤维和种子发育来决定衣分。

原文链接：https://doi.org/10.3389/fpls.2016.01576