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Genome sequence of cultivated Upland cotton (Gossypium hirsutum TtM-1) provides insights into genome evolution

  • 期刊名称Nature Biotechnology
  • 发表年份2015
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  • 添加时间2021年09月17日

论文简介:在本研究中,科研人员整合了全基因组散弹枪法、BAC-to-BAC、高密度遗传图谱构建等策略,对陆地棉遗传标准系—TM-1进行了全基因组测序和组装,最终获得了26条染色体。通过基因组注释,得到了76943个蛋白编码基因。利用比较基因组学方法,首次从全基因组水平揭示了四倍体棉花的是由A基因组的祖先和D基因组的祖先通过染色体融合而形成,并初步揭示了四倍体棉花基因组的进化规律。同时,通过两个二倍棉花和四倍体棉花不同纤维发育时期乙烯代谢通路的基因组比较和相关的实验证据,证实了乙烯调控纤维伸长的双向调节假说—纤维伸长发育过程中,乙烯过多和不足都会抑制棉纤维的伸长,这是不同棉种间纤维长度存在差异的重要原因之一。

论文链接:https://www.nature.com/articles/nbt.3208.pdf